驻马店市农业农村局行政审批服务科工作职责：
主要负责农业行政审批综合办理，组织开展农业综合行政执法监督，监督落实行政执法责任，承担市级行政执法职责，统筹协调重大农业违法案件查处、跨区域执法等工作。
驻马店市农业农村局政策与改革科工作职责：
主要负责指导发展农村新型农业经营主体和多种形式适度规模经营、农民合作经济组织建设与发展，组织开展农民合作社示范创建、落实财政支持农民合作社发展相关政策等工作。
驻马店市农业农村局农畜产品质量安全监管科工作职责：
主要负责农畜产品从种植养殖环节及食用农产品、畜禽产品进入批发、零售市场或生产加工企业前的质量安全监督管理，农畜产品认证和监督管理，无公害农畜产品认定和农产品地理标志登记等工作。
驻马店市农业农村局畜牧科工作职责：
主要任务是抓好全市畜牧业生产，对畜牧业结构调整、规模化养殖、产业化经营、标准化生产、绿色化发展加强指导，做大做强做优畜牧产业，推动全市畜牧业高质量发展，同时对种畜禽生产经营和生鲜乳收购经营强化管理。
驻马店市农业综合行政执法支队工作职责：
主要承担本级农业农村部门的执法职责，授权行使“三个功能区”的兽医兽药、畜禽屠宰、种子、化肥、农药、渔业、农机、农产品质量、植物等行政处罚以及与行政处罚相关的行政检查、行政强制等职能。
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